由于第二波新冠肺炎疫情加速蔓延，1月31日至2月14日，秘鲁首都利马和伊卡省、胡宁省、安卡什省等9个省份再次实行强制性社会隔离措施，此外，马丘比丘等国内著名旅游景点也实行了关闭措施。
尽管马丘比丘所在的库斯科省不属于实行强制性社会隔离措施的地区之内，但为遏制第二波疫情蔓延，秘鲁政府仍对其采取了关闭措施。
2020年3月新冠肺炎疫情在秘鲁暴发以后，马丘比丘关闭了近8个月的时间，于2020年11月1日重新开放，在开放以后，每日仅限675名游客进入参观，游客接待量仅为疫情暴发以前的30%，使之成为是拉美地区关闭时间最长、防疫措施最严格的旅游景点之一。
据悉，除马丘比丘以外，秘鲁萨克塞华曼考古公园、莫瑞圆形梯田遗址、纳斯卡线条、的的喀喀湖、瓦斯卡兰山等旅游景点也实行了关闭措施，这些旅游景点的关闭时间至少将持续至2月14日。
